Forskare vid Uppsala universitet, Stockholms universitet och KTH, har lyckats skapa en ny spatial omics-metod. Genom att kombinera tvĂ„ komplexa tekniker som vanligtvis anvĂ€nds separat â avbildande masspektrometri, MSI, och spatial transkriptomik, SRT â har man tagit ett viktigt steg inom forskningen om biologiska vĂ€vnader. Studien publicerade i tidskriften Nature Biotechnology.
Peer review/Imaging analysis/Human and animal tissue samples
â VĂ„r metod kan avbilda bĂ„de lĂ„gmolekylĂ€ra metaboliter, till exempel hjĂ€rnans signalsubstanser, och RNA-transkript â i samma biologiska vĂ€vnadssnitt â utan att kompromissa med kvaliteten eller noggrannheten i resultaten. Resultaten av studien har potential att förĂ€ndra fĂ€ltet för spatial biologi och sjukdomsforskning, sĂ€ger Per AndrĂ©n, professor i avbildande masspektrometri vid Uppsala universitet och SciLifeLab och en av studiens författare.
Metoden, framgÄngsrikt exemplifierad med vÀvnadssnitt frÄn bÄde möss och mÀnniskors hjÀrnor, inriktades pÄ signalsubstanser och deras roll i Parkinsons sjukdom. Genom att analysera de komplexa molekylÀra nivÄerna i ett och samma vÀvnadssnitt kan forskarna fÄ bÀttre kunskaper om Parkinsons sjukdom och andra komplexa sjukdomar.
En viktig del av metoden Àr att den inte bara gör det möjligt att avbilda molekyler och deras distribution i vÀvnaden, utan man kan ocksÄ samtidigt analysera genernas aktivitet. Det hÀr tillvÀgagÄngssÀttet ger forskarna möjligheter att undersöka sambandet mellan genuttryck och molekylÀr aktivitet pÄ en högre nivÄ.
â TillĂ€mpningen av metoden strĂ€cker sig bortom neurobiologi och har potential att förĂ€ndra landskapet inom olika omrĂ„den av biologisk och medicinsk forskning, till exempel onkologiforskning. Genom att studera tumörmiljöer och behandlingsresponser pĂ„ molekylĂ€r nivĂ„ kan metoden vara en inkörsport till att förstĂ„ komplexa sjukdomar och optimera behandlingsstrategier, sĂ€ger Per AndrĂ©n.
Forskningen har stöd frÄn VetenskapsrÄdet, Stiftelsen för Strategisk Forskning, Knut and Alice Wallenberg Stiftelse, HjÀrnfonden, the Leona M. and Harry B. Helmsley Charitable Trust, EU H2020 EASI-Genomics och SciLifeLab. Forskarna tillhör SciLifeLab-plattformen för Spatial Biology.
Artikeln: Marco Vicari et al., ’Spatial multimodal analysis of transcriptomes and metabolomes in tissues’ has been scheduled for publication in Nature Biotechnology, 10.1038/s41587-023-01937-y, https://www.nature.com/articles/s41587-023-01937-y
För mer information:
Per Andrén, professor i avbildande masspektrometri vid institutionen för farmaceutisk biovetenskap, Uppsala universitet och SciLifeLab, e-post: per.andren@uu.se, telefon: 018-471 72 06, mobiltelefon: 070-167 93 34
Joakim Lundeberg, professor i molekylÀr bioteknologi vid institutionen för genteknologi, KTH och SciLifeLab, e-post: joakim.lundeberg@scilifelab.se
Uppsala universitet Àr Sveriges Àldsta universitet, grundat 1477. Vi har över 50 000 studenter och 7 500 medarbetare i Uppsala och i Visby. Vi Àr ett brett forskningsuniversitet med forskning inom samhÀllsvetenskaper, humaniora, teknikvetenskap, naturvetenskap, medicin och farmakologi. Universitetet Àr Äterkommande rankat som ett av vÀrldens frÀmsta universitet, med mÄlet att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra lÄngsiktig skillnad i samhÀllet.
